Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf8Q99PV0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf8Q99PV0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms