Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP6

Trim34a, Tripartite motif-containing protein 34A, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34aQ99PP6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim34aQ99PP6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim34aQ99PP6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim34aQ99PP6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim34aQ99PP6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms