Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms