Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim8Q99PJ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms