Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsmfQ99NF2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsmfQ99NF2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms