Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Rims1Q99NE5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms