Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brms1Q99N20 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brms1Q99N20 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brms1Q99N20 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brms1Q99N20 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brms1Q99N20 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brms1Q99N20 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brms1Q99N20 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms