Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp1b4Q99ME6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1b4Q99ME6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms