Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tm2d1Q99MB3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tm2d1Q99MB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms