Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprtQ99M80 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms