Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epdr1Q99M71 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epdr1Q99M71 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Epdr1Q99M71 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms