Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms