Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd1Q99J36 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms