Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctu1Q99J10 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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