Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rnf144aQ925F3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Rnf144aQ925F3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Rnf144aQ925F3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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