Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms