Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms