Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms