Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrif1Q923B3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms