Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf3Q922U1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms