Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms