Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Clip1Q922J3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms