Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca5Q91ZW3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms