Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms