Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms