Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn3Q91V61 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms