Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1fooQ8VIK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms