Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng5Q8VHW4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms