Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps4aQ8VEJ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms