Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEH2

Ciz1, CDKN1A-interacting zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciz1Q8VEH2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ciz1Q8VEH2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms