Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM1

Zgpat, Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZgpatQ8VDM1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZgpatQ8VDM1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZgpatQ8VDM1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms