Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alg12Q8VDB2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms