Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt25Q8VCW2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms