Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc2Q8VBV3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms