Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ApobrQ8VBT6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms