Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk8Q8R3L8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk8Q8R3L8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms