Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf3Q8R3J4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms