Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r200Q8R281 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms