Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms