Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.6 ms