Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Vmn1r72Q8K3N7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r72Q8K3N7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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