Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OptnQ8K3K8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OptnQ8K3K8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms