Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk5rap2Q8K389 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk5rap2Q8K389 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms