Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcho1Q8K285 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcho1Q8K285 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms