Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c1Q8K284 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf3c1Q8K284 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms