Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Spire2Q8K1S6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms