Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm17Q8JZX4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms