Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d5Q8JZW5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh2d5Q8JZW5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms