Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms