Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf628Q8CJ78 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms